Хантавирус в первые дни после инкубационного периода проявляется как обычный грипп: поднимается температура, болит голова, ломит мышцы, тошнит и рвет. Однако через 3–5 дней начинаются осложнения — отек лёгких или сердечная недостаточность.

Инкубационный период при заражении хантавирусом Андес в среднем составляет от двух до четырёх недель, максимум — шесть недель. Само заболевание проходит две стадии. Сначала 3–5 дней человек чувствует себя как при гриппе.

Затем наступает кардиопульмональная фаза: быстро развивается одышка, кашель, чувство нехватки воздуха из-за отека лёгких, падает давление и наступает сердечная недостаточность. В этот момент больному нужна срочная госпитализация.

Болезнь развивается стремительно и очень опасна — умирают около 40% заболевших. Заразить других человек может, только когда у самого уже есть симптомы.